De 12-jarige Mikal werd geboren en opgevoed in een hotelkamer die hij deelt met zijn ouders, die worstelen met verslaving. Gedreven door liefde en de wens voor een beter leven, is Mikals grootste verlangen dat zijn moeder stopt met drinken. Maar wat is er werkelijk nodig om iemand te laten veranderen?

Door de ernstige woningcrisis in de VS worden veel gezinnen gedwongen te wonen in vervallen, goedkope hotels, die bekend staan als Flophouses. Regisseur Monica Strømdahl heeft jaren besteed aan het documenteren van deze realiteit, waarbij ze de worstelingen en veerkracht vastlegt van de mensen die deze tijdelijke onderkomens als thuis beschouwen. Vier jaar geleden ontmoette ze Mikal, een van de vele kinderen die opgroeien onder deze precaire omstandigheden. Door zijn verhaal te delen, hoopt Mikal een verborgen crisis aan het licht te brengen en anderen in vergelijkbare situaties te helpen.

Flophouse America volgt Mikal terwijl hij een jeugd doormaakt die gekenmerkt wordt door armoede, verslaving en instabiliteit. Mikal is slim en welbespraakt, maar de worstelingen van zijn ouders verhinderen hen om hem de stabiliteit te geven die hij nodig heeft. Door Mikals perspectief schildert de film een intiem portret van veerkracht, hoop en de harde realiteit van het leven aan de rand van de samenleving.